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일반화학

SMILES (1): 튜토리얼

영웅시대 2022. 3. 26. 09:02
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SMILES 는 무엇인가요?

 

SMILES(Simplified Molecular Input Line Entry System)는 사용자가 컴퓨터에서 사용할 수 있는 방식으로 화학 구조를 나타낼 수 있도록 하는 화학 표기법입니다. SMILES는 배우기 쉽고 유연한 표기법입니다. SMILES 표기법을 사용하려면 몇 가지 규칙을 배워야 합니다. 소프트웨어가 필요할 때 고유한 SMILES 문자열로 항목을 자동으로 재정렬하기 때문에 모호한 표현에 대해 걱정할 필요가 없습니다.

 

SMILES는 미국 환경 보호국, Mid-Continent Ecology Division-Duluth, MN(MED-Duluth) Duluth, CA, Claremont, Pomona College의 의약 화학 프로젝트 및 Computer Sciences Corporation, Duluth, MN의 자금 지원을 통해 개발되었습니다. Anderson et al.을 비롯한 여러 간행물에서 SMILES에 대해 자세히 설명합니다. 1987, Weininger 1988, Weininger et al. 1989, Hunter et al., 1987.

 

SMILES에는 반드시 준수해야 하는 5가지 기본 구문 규칙이 있습니다. SMILES 항목에서 화학의 기본 규칙을 따르지 않으면 시스템은 사용자에게 경고하고 구조를 편집하거나 다시 입력하도록 요청합니다. 예를 들어 사용자가 원자에 너무 많은 결합을 배치하면 구조가 불가능하다는 SMILES 경고가 나타납니다. 규칙은 아래에 설명되어 있으며 몇 가지 예가 제공됩니다. 아래 규칙은 화학 물질의 2차원 구조를 나타내는 것을 허용합니다. ASTER 시스템의 경우 2차원 묘사가 적절합니다. 구조 이성질체인 화학 물질에 대해 다른 규칙을 사용할 수 있지만 이 기본 자습서에서는 논의하지 않습니다.

 

출처: https://archive.epa.gov/med/med_archive_03/web/html/smiles.html

 

2022.03.26 - [일반화학] - SMILES (2): 규칙

 

SMILES (2): 규칙

규칙 1: 원자와 결합 SMILES는 주기율표의 모든 원소를 지원합니다. 원자는 각각의 원자 기호를 사용하여 표시됩니다. 대문자는 비방향족 원자를 나타냅니다. 소문자는 방향족 원자를

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